2013年，深圳港完成集装箱吞吐量2327.8万标准箱，居全球第三。其中，深赤湾A全年完成货物吞吐量 6589.4 万吨，同比增长 7.1%；集装箱吞吐量累计完成 534.60万TEU，同比增长 0.7%；散杂货吞吐量累计完成 1331.1 万吨，同比增长 24.4%。
公路方面，广东省省高速公路新增通车里程181公里，全年累计完成投资650亿元，同比增长47%，其中7个项目建成通车，13个项目896公里新开工建设。
值得注意的是，广东省加强收费公路专项清理，全面整改收费公路年限超期、站距不足等问题，取消收费项目31个，撤销了21个收费站，核减了31个项目的收费年限，减少收费公路里程651公里。
2014年，广东省将进一步深入推进收费公路专项清理工作，加强收费公路监管，规范收费公路和高速公路服务区的运营管理等。有分析指出，这对广东本土的高速公路公司深高速、粤高速A及东莞控股有一定的负面影响。
此外，2013年，深圳市物流业增加值预计超过1400亿元，约占GDP的1/10；轨道交通建成运营178公里，在建107公里；累计推广应用新能源汽车6363辆，居全球城市前列。
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